农业病理研究室隶属于青海省农林科学院和青海省农业有害生物综合治理重点实验室，主要围绕“粮食安全、生态安全、绿色发展”战略需求，在作物病害流行学、监测预警、抗病育种与病害综合治理技术等方面开展研究，培养知农爱农创新型人才，以期加快打造青海省绿色有机农畜产品输出地，因地制宜做强高原特色农业，保障国家粮食安全。团队现有固定研究人员3人，研究生10余人。在乐都、大通、贵德、尖扎等地建立了10多个小麦抗病育种基地及病害监测试验点。取得的主要成果：
1. 作物病害监测预警研究
创新构建了基于GBTS靶向测序的小麦条锈菌基因分型技术，开发了20 K GBTS基因芯片，建立了全国小麦条锈菌指纹数据库和毒性监测平台，并融合病菌孢子捕捉、气象监测、图像识别和高空气流模拟手段，形成了多模态集成的小麦条锈病自动监测预警技术体系。
形成了卫星遥感监测作物寄主种植分布及面积勘测，无人机遥感田间巡检作物病害发生流行动态，地面病菌孢子捕捉、高光谱表型监测及AI环境自动监测多源数据汇集的天空地一体化监测技术体系。
构建了高原特色作物病虫草害智能识别系统，并提供相应的综合防控手段。
2. 小麦条锈病流行学研究
长期围绕我国小麦条锈病关键策源地--青海越夏区，综合运用田间系统调查、群体毒性分析、分子群体遗传学、高空风场轨迹模拟及智能监测等多学科方法，系统研究了小麦条锈菌在青海越夏区的成因机制、菌源时空分布特征及其在全国条锈病流行中的地位作用及影响，并构建了青海越夏区小麦全生育期病害防控技术体系在全省范围内示范应用。
揭示了青海越夏区小麦条锈菌策源地形成与灾变的关键机制，明确了春麦、晚熟春麦及自生麦苗在菌源衔接以及菌源越冬在周年循环中的作用，阐明了冬麦扩种对青海局部地区菌源周年循环的重要影响，系统阐释了青海作为全国秋季条锈病核心菌源区的地位与作用，明确了青海省是我国西北越夏区最大越夏“菌源库”，并策源全国小麦条锈病的秋季流行。
3. 植物抗病机制研究
主要植物病原菌致病机制及植物抗病机制研究、天然产物源药剂开发、新农药创制及应用性评价、病原菌快速检测技术的构建与应用展开。建立了青稞鞘腐病菌的LAMP快速检测技术及RPA-LFD快速检测方法；解析了青稞鞘腐病菌在侵染进程中毒素产生特征及其对寄主防御生理的致病机制；解析了抗病品种对病原侵染的生理与分子响应机制，明确苯丙烷生物合成途径和抑菌代谢物松柏醛在抗病中的关键作用 ；建立了离体叶片接种和田间穗部注射两种抗性鉴定方法，对已有品种进行系统评价，筛选出一批高抗品种。
4. 人才培养
培养博士、硕士研究生40余人，其中1人获2025年青海省直接引进拔尖人才（陈李一凡）继续留在团队工作，他们多数已成为领域内骨干成员。实验室现有在读研究生15人。